รหัสลับ เซเลอร์วี เป็นเรื่องราวของ ไอโนะ มินาโกะ นักเรียนชั้น ม.1 มีนิสัยบ้าดาราเป็นอย่างมาก แล้ววันหนึ่งเธอก็ได้เจอกับแมวตัวผู้ขนสีขาวหน้าผากแหว่งจันทร์เสี้ยวมีชื่อว่าอาร์เทมิส อาร์เทมิสได้ให้ตลับวงเดือนมา ในขณะที่มินาโกะ กำลังถูกปีศาจทำร้าย แล้วหลังจากนั้น มินาโกะได้ตะโกนมนต์แปลงร่างว่า มูน พาวเวอร์ ทรานส์ฟอร์ม ทำให้มินาโกะกลายเป็นเซเลอร์วีแต่มินาโกะไม่ได้ทำงานให้กับอาร์เทมิสคนเดียว แต่เธอให้กับคนที่ เรียกว่าบอสของเธออีกด้วย หน้าที่หลักที่สำคัญของเธอคือ การหาเบาะแสดำมืดในคดีต่างๆเกี่ยวกับดารา และเบื้องหลังความชั่วร้ายของคดีดำมืดคือ องกรดาร์คเอเจนซี่ เป็นองค์กรปลุกปั้นดาราเพื่อหาอำนาจมืด ภายหลังได้รู้ว่า ดาร์คเอเจนซี่คือองค์กรย่อยของดาร์คคิงด้อม เมื่อเธอคลี่คลายปัญหาดาร์คเอเจนซี่เสร็จ เธอยังร่วมมือกับตำรวจในการจับคนร้ายและสืบหาเบาะแสของดาร์คคิงด้อม (แม้ว่าจะไม่เต็มใจในการให้ความร่วมมือก็ตาม)